Cé go meastar go bhfuil probiotics tairbheach don tsláinte, do roinnt daoine, is féidir le hionghabháil tosaigh na miocrorgánaigh seo raon comharthaí míchompordacha a chur faoi deara. Nuair a thógann siad probiotics den chéad uair, d'fhéadfadh go mbeadh comharthaí cosúil le bloating, buinneach, tinneas cinn, fiabhras, pian muscle, ceo inchinn, agus b'fhéidir imní orthu. Ceaptar gur freagairt iad na hairíonna seo ar athruithe a tharlaíonn sa chorp, amhail meath pataiginí féideartha nó freagairtí stéigeacha a athghníomhú, feiniméan dá ngairtear "imoibriú Herxheimer" uaireanta.
Is freagairt tosaigh é imoibriú Herxheimer a léiríonn go hiondúil go bhfuil an comhlacht ag oiriúnú do thimpeallacht mhiocróbach nua. D'fhéadfadh sé seo a bheith mar gheall ar na probiotics a idirghníomhaíonn leis an bpobal miocróbach atá ann cheana féin, is cúis le bás na baictéir nó scaoileadh meitibilítí a spreagann na hairíonna seo. Cé go bhfuil sé míchompordach, is gnách go mbíonn an t-imoibriú seo gearr-chónaí agus íslíonn sé go tapa. Is féidir smaoineamh air mar chuid de phróiseas hoiméastáis an chomhlachta.
Is iondúil nach mbíonn tionchar aige seo ach ar líon beag daoine, le hairíonna éadrom agus de ghnáth ní mhairfidh sé ach cúpla lá go cúpla seachtain. Má fhágann na hairíonna seo míchompordach tú, is féidir leat do dáileog a laghdú nó stop a úsáid ar feadh cúpla lá sula ndéanfaidh tú iarracht eile; má leanann na hairíonna seo ar feadh níos mó ná cúpla seachtain, stop a úsáid; má tá ganntanas anála agat, scornach daingean, coirceoga, nó comharthaí frithghníomhartha ailléirgeacha eile, le do thoil stop a úsáid láithreach. Chun an fhéidearthacht fo-iarsmaí a laghdú, go háirithe dóibh siúd a bhfuil córais díleácha íogair acu, tá sé ciallmhar tosú le méid beag probiotics agus ansin an dáileog a mhéadú thar chúpla seachtain.
Ní mór próbiotics a úsáid le cúram ar leith dóibh siúd a bhfuil easnaimh imdhíonachta tromchúiseacha acu, mar i gcásanna neamhchoitianta, d'fhéadfadh ionfhabhtú a bheith mar thoradh ar ionghabháil probiotic. Tá sé seo amhlaidh toisc nach féidir leis an gcóras imdhíonachta iomadú na miocrorgánach sa chorp a rialú go héifeachtach, rud is cúis leis an mbaol ionfhabhtaithe.
D'fhéadfadh frithghníomhartha ailléirgeacha a bheith ag roinnt daoine ar chineálacha áirithe probiotics, go háirithe giostaí a bhaineann le Saccharomyces boulardii. Go ginearálta ní spreagann cineálacha eile probiotics, mar shampla lactobacilli, frithghníomhartha ailléirgeacha.
Is féidir le roinnt probiotics histamine a tháirgeadh sa chonair díleá. Is féidir le heisiúint iomarcach histamine a bheith ina chúis le hairíonna cosúil le tochas, táirgeadh cuimilte méadaithe, srón rite, deacracht análaithe, deargadh agus at, go háirithe dóibh siúd a bhfuil éadulaingt histamine orthu. Seachain na tréithchineálacha probiotic seo chun míchompord a chosc.